小智一行人将面对新的口袋妖怪游侠，并见识到许多前所未见的深海系口袋妖怪。可爱的皮卡丘这次找到了新的伙伴——一条鲸鱼。新的剧场版继续使用全3D场景，辅以2D人物的技术制作，预定2006年7月15日在东宝系全国剧院上映。